Discusión filogenética

A pesar de que se encuentran abundantes restos de A. africanus, ha sido difícil para los científicos, establecer relaciones filogenéticas con las posteriores (Paranthropus robustus y Homo habilis). Además de esto, los yacimientos ubicados en Sudáfrica son de difícil extracción y datación. Los rasgos craneodentales se aproximan más a Homo que A. afarensis, mientras que las proporciones físicas son más primitivas que las de afarensis y las uniones de los huesos de los brazos son de igual manera, más arcaicas. 

• Para Lockwood y Tobias A. africanus es la especie ancestral tanto del Paranthropus como del Homo. Mientras que Cely y Ayala creen que es el posible iniciador del linaje robusto.
• Debido a que la dentinción de A. africanus parece más moderna Tobias, Clarke y Berger proponen que los
  primeros Homo están relacionados con africanus y no con afarensis.
• Tobias (1980) considera afarensis y africanus como variantes geográficas de una misma especie.
• Berger y Hilton-Barber, piensan que africanus podría descender de anamensis o de algún taxón similar que se expandió por África del Este y del Sur y dio lugar a afarensis en entornos más abiertos y a africanus en entornos más cerrados.